儿童心律不齐的原因，主要是先天性的心律失常和后天获得性的心律失常。
先天性的心律失常常见于先天性的心脏病、旁路传导，宫内的感染常见的是巨细胞病毒、风疹病毒感染导致窦房结、房室结引起的心率变化，起搏传导系统未发育成熟常见于新生儿、早产儿。
家族性心律失常一般都有家族史，症状可轻可重，在以小儿猝死后进行家谱分析、检查才可以做出诊断。
后天获得性的心律失常比较多见，感染性疾病、心脏的手术，还有其它结缔组织疾病、心肌病、克山病等，还有内分泌代谢病、甲功亢进都可以导致心动过速。
还有一些药物可以引起，比如洋地黄中毒、阿托品中毒、奎尼丁中毒等，还有电解质紊乱、酸中毒、肿瘤压迫传导系统，这些都是引起心律失常的主要原因。